Tandis que l'Homme à la cigarette récite à un auditeur invisible les agissements du Syndicat, un complot mondial mené en collaboration avec une espèce extraterrestre, Cassandra Spender réapparaît, poursuivie par les scientifiques qui préféreraient la tuer plutôt que de la laisser en vie. Cassandra se réfugie dans l'appartement de Mulder et exige qu'il l'abatte, car elle est l'aboutissement de cinquante années de travail : un hybride humain-extraterrestre vivant.