Après le rassemblement sur le lieu de l'enlèvement, où tous sont tués par les chasseurs de primes rebelles, Cassandra Spender disparaît. Son fils, Jeffrey, un agent du FBI prometteur, accuse Mulder. Pendant ce temps, le Syndicat poursuit ses essais cliniques pour créer un vaccin contre le Cancer Noir, et Marita Covarrubias devient malgré elle un cobaye.