Père apprend que Numéro 3 se rend dans son pays d'origine pour rencontrer la branche japonaise secrète des Kids Next Door ; Il envoie donc ses meilleurs espions, les Jumeaux Intéressants des Profondeurs de la Montagne, suivre Kuki et localiser la cachette des agents japonais afin de lancer une attaque. Mais lorsque les deux jeunes espions suivent Numéro 3, une combinaison de leurs... 366.