Kusanagi et son petit ami sont transportés d'urgence à l'hôpital après avoir été attaqués sans avertissement. Ils soupçonnent Toru Soma, un terroriste avec lequel Kusanagi a des antécédents. Kusanagi et Togusa quittent l'hôpital, et après avoir mené leurs poursuivants à la poursuite, ils se retrouvent dans une bataille acharnée contre un groupe armé dans une usine abandonnée.