Un adolescent japonais se réveille seul dans une pièce vide, sans aucun souvenir de son identité ni de son passé. Il explore les lieux et découvre qu'il est un touriste japonais. Soudain, il réalise que son seul souvenir est celui d'une tentative d'assassinat. Alors qu'il explore le bâtiment apparemment abandonné, il est de nouveau attaqué par la personne masquée de ses souvenirs, qui lui ordonne de se battre de toutes ses forces ou de mourir. Pendant ce temps, quelqu'un observe ses actions à distance. Décidé à vivre, il riposte et prend momentanément l'avantage. Au moment où il s'apprête à porter le coup fatal, le masque se fissure et son agresseuse se révèle être une jeune fille. Il tente alors de s'enfuir, mais se retrouve en plein désert. La jeune fille, qui ne l'attaque plus et se présente comme Ein, lui annonce qu'il devra désormais choisir entre vivre et devenir un assassin du nom de Zwei, ou mourir. Ces scènes alternent avec des flash-forwards montrant Zwei et Ein travaillant ensemble sous le nom de « Phantom » lors d'une mission d'assassinat. Ein, se faisant passer pour une domestique, et Zwei parviennent à éliminer toute une maison de gardes armés ainsi que le chef d'un parrain de la mafia à Las Vegas, prouvant une fois de plus leur puissance absolue et leur indispensabilité pour une mystérieuse organisation nommée Inferno.