Lorsque deux bombes sèment la mort et la destruction parmi la foule de coureurs et de spectateurs à l'arrivée du marathon de Boston, le FBI prend les choses en main et lance une vaste chasse à l'homme pour retrouver les auteurs. Sous le regard rivé du pays, le Bureau et ses partenaires des forces de l'ordre travaillent d'arrache-pied pour appréhender les poseurs de bombes avant qu'ils ne frappent à nouveau. Une fois appréhendés, les suspects entraînent les autorités dans une course contre la montre mortelle à travers les rues de Boston.