Un étudiant ivre découvre le corps sans vie d'un agent des services secrets juste avant une visite présidentielle dans la région. Booth est prêt à se lancer immédiatement et se tourne vers Brandt Walker, agent des services secrets et ancien collègue, pour obtenir des informations. Il est cependant surpris d'apprendre que les services secrets ont des réserves quant à son implication dans l'affaire. L'équipe découvre des preuves choquantes qui aggravent la gravité de l'affaire, poussant Booth à s'engager pleinement pour son pays. Pendant ce temps, Brennan est en arrêt maladie, souffrant de la grippe, et l'ancien interne, le Dr Colin Fisher, revient au Jeffersonian pour diriger l'enquête. Brennan refuse cependant d'être tenue à l'écart. Par ailleurs, Hodgins prend sa vie en main et change radicalement de comportement après une expérience potentiellement dangereuse.