Le sort de l'agent P est enfin révélé dans le final haletant du double épisode spécial qui a laissé Phineas, Ferb et leurs amis au bord du précipice, littéralement au bord d'un ravin inexploré, et Candace paniquée après un appel téléphonique avec Jeremy qui a semé le doute dans leur relation. L'agent P étant désormais introuvable, le Dr Doofenshmirtz et le Major Monogram affrontent le maléfique Carl, qui contrôle des robots aux allures familières pour prendre le contrôle de l'OWCA, dans l'une des plus grandes batailles à ce jour.