Chuck, Sarah et Casey découvrent l'existence d'un certain « Persée », instigateur du projet de Fulcrum de construire son propre Intersect. Sarah et Casey sont envoyées à sa recherche, tandis que Chuck et l'agent Cole Barker sont contraints de se réfugier dans un bunker. Lorsque la mission prend une tournure dangereuse, ils enfreignent les consignes de sécurité. De son côté, Morgan tente de convaincre Anna qu'emménager avec lui serait une mauvaise idée.