« …Que représente le cœur pour vous ? » « Notre but est d'anéantir toute l'humanité. » D'après les calculs des Archives, la base de données d'IA intégrée, l'humanité est au bord de l'extinction. Alors que le compte à rebours vers l'extinction commence, Vivy et Matsumoto décident de s'allier à leur ennemi juré, Toak, afin d'élaborer une stratégie pour infiltrer Arayashiki, le cœur des Archives. Cependant, Matsumoto entrevoit une solution possible qu'il présente à Vivy après que celle-ci a été contactée par les Archives.