L'équipe HEAT enquête sur une gigantesque mutation ressemblant à une chenille, connue sous le nom de Mégapède, qui ravage les États voisins de l'Illinois et de l'Indiana. Godzilla est appelé à la rescousse, mais le Mégapède projette une sorte de mousse toxique et possède également des éperons venimeux le long de ses nombreuses pattes, deux armes qui permettent de tenir le Roi des Kaiju à distance. Le méga-insecte finit par escalader un immeuble, se transforme en cocon et devient une immense créature insectoïde ailée qui brouille les fréquences radar en frottant ses ailes l'une contre l'autre, provoquant ainsi de nombreux ravages. L'équipe H.E.A.T. conçoit une mousse neutralisant le poison qu'elle répand sur les ailes du kaiju, permettant à Godzilla de l'attaquer et de le vaincre plus facilement.